鸭坦布苏病毒(DTMUV)是一种新兴的黄病毒,给中国禽类产业带来了重大经济损失。快速准确检测 DTMUV 对于有效防控措施至关重要。来自福建农林大学动物科学学院的研究团队在《Animals》期刊发表了一种新型的现场检测 DTMUV 的技术,其主要策略是将逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)与 CRISPR/Cas12a 系统相结合。
研究发现,该技术可在 100 分钟内灵敏特异地检测含 DTMUV NS3 基因,最低检测限为 19.3 拷贝 / 微升。该团队成功将 RT-LAMP-CRISPR/Cas12a 检测方法应用于 8 个鸭胚和 11 个鸡胚成纤维细胞样本的 DTMUV 诊断,检测结果与 RT-qPCR 结果一致。值得一提的是,该研究中使用的工具酶srCas12a-18来自武汉尚睿生物科技有限公司,货号为Cat No. SRB-CAS-001。研究表明,RT-LAMP-CRISPR/srCas12a-18 检测方法可靠、灵敏、特异且用户友好,有望用于 DTMUV 临床样本的早期现场检测,便于及时干预和改善禽类产业疾病管理。
主要结果:
(1)RT-LAMP-CRISPR/Cas12a 检测方法的建立:研究团队成功开发了一种用于检测鸭坦布苏病毒(DTMUV)的 RT-LAMP-CRISPR/srCas12a-18 快速可视化检测方法。该方法包括 RNA 快速提取、RT-LAMP 扩增、Cas12a 酶切反应以及荧光检测,整个流程仅需约 100 分钟。
(2)引物和 crRNA 的筛选:研究人员筛选出针对 DTMUV 高度保守的 NS3 基因的高效引物对和 crRNA,其中 NS3-crRNA-2 在不同 DTMUV 菌株中具有高度保守性,被选为检测用 crRNA。
(3)检测灵敏度评估:通过梯度稀释含 DTMUV NS3 基因的克隆质粒,确定 RT-LAMP 扩增的检测下限为 19.3 拷贝,RT-LAMP-CRISPR/srCas12a-18 检测方法的灵敏度也达到 19.3 总拷贝,表明该方法具有高灵敏度。
(4)检测特异性评估:使用含有 MDRV σC 基因的合成质粒作为对照,结果显示该方法对 DTMUV 具有严格的特异性,无交叉反应。
(5)临床样本检测验证:对 8 个鸭胚和 11 个鸡胚成纤维细胞样本进行检测,结果与 RT-qPCR 方法完全一致,准确率达到 100%,且该方法成本更低、操作更简便,适合现场使用。
参考文献:
Chen J, Tao D, Yang F, Pan C, Bao X, Xie S, Gong P, Zhao C, Lin R. Development of a Rapid Visual Detection Assay for Duck Tembusu Virus Using RT-LAMP-CRISPR/Cas12a. Animals 2024, 14(23), 3439; https://doi.org/10.3390/ani14233439